NASA在2005年的时候发现了一个太阳系外的类地行星，并判断其上可能存在智慧生命。为了能与外星智慧生物接触，NASA启动“灯塔计划”，在夏威夷启用深空通信阵列基地，向其发射高功率信号进行试探。几年后，外星飞船不期而至。身处夏威夷的太平洋联合海军演习舰队受命进行接触。男主角海军中尉阿历克斯（泰勒·克奇 Taylor Kitsch 饰）所在的导弹驱逐舰及其他两艘军舰被作为侦查小队，受命接触外星舰船。却因此受到攻击，损失惨重。由于外星舰船展开的护盾原因，联合舰队的其他舰船无法实施支援，完全只能靠自己苦苦支撑。
五年前，仿佛被魔鬼所控制的凯蒂（Katie Featherston 饰）杀害了自己的男朋友、姐姐、姐夫，并带走他们尚在襁褓中的孩子亨特，不知所终。时间来到2011年，一个平凡幸福的四口之家，美丽女孩爱丽克丝（凯瑟琳·牛顿 Kathryn Newton 饰）过着无忧无虑的生活，她每天和男友本（麦特·西弗里 Matt Shively 饰）通过视频聊天，平日里本也会拿着摄像机随时拍摄。某天，无依无靠的小男孩罗比（Brady Allen 饰）入住爱丽克丝的家，罗比沉默寡言，并声称有一个名叫托比的朋友。爱丽克丝他们
继杰森·伯恩后，另一美国中情局特工艾伦.克劳斯Aaron Cross（杰瑞米·雷纳 Jeremy Renner 饰）亦将身陷险境。因为“杰森·伯恩事件”，令中情局的特工行动“绊脚石Treadstone”被公开，为了隐瞒其它特工行动，以拜亚ret. Colonel Eric Byer（爱德华·诺顿 Edward Norton 饰）为首的美国中情局，正计划铲除过去数十年来发展的特工行动，包括“结果Outcome”行动当中，体能和智能更“先进”的“5号”特工艾伦.克劳斯，展开横跨全球的逃杀。而艾伦.克劳斯剩下的
